再生障碍性贫血患者 RNA 互作网络分析及潜在治疗药物预测
王紫宁, 陈浩然, 张钧栋, 李泓毅, 张昊军, 卢学春
华中科技大学学报(医学版). 2023, 52(2):
166-173.
doi:10.3870/j.issn.1672-0741.2023.02.005
摘要
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多维度评价
摘要:目的 探究再生障碍性贫血(aplastic anemia,AA)患者骨髓 T 细胞差异表达的微小核糖核酸(microRNA,
miRNA)和信使 RNA(messenger RNA,mRNA)基因,构建互作调控网络并筛选药物,随后评估其治疗方案疗效。方法
在基因表达数据库检索并进行综合分析,使用 R语言对 AA 相关 miRNA 与 mRNA 进行差异表达分析,并通过 miRNet
预测差异表达 miRNAs(DE-miRNAs)的靶向 mRNAs,并与差异表达 mRNAs(DE-mRNAs)进行比较与负相关配对,得
到失调 mRNAs,再对失调 mRNAs进行功能基因注释(GO)分析与通路富集(KEGG)分析,构建 AA 的 miRNA-mRNA
互作调控网络。采用自主研发的表观精准治疗平台(EpiMed)进行潜在治疗药物预测,并将盐酸二甲双胍纳入新型联合
治疗方案中,对入组的40例难治性 AA 进行临床疗效评估,评估主要指标包括血红蛋白、中性粒细胞绝对值、血小板计
数及输血依赖等。结果 差异分析最终获得26个 DE-miRNA 与168个靶向 DE-mRNA,对其进行构建调控网络。GO
和 KEGG分析结果显示,AA 相关失调 mRNA 可能参与 T细胞分化、造血调控、物质代谢等过程,与病毒感染、细胞脂向
分化、细胞凋亡以及物质代谢等信号通路相关。通过 EpiMed预测得到环孢素 A、吗替麦考酚酯、雷帕霉素、二甲双胍、
维生素 B、白藜芦醇等药物可能具有治疗 AA 的作用。研究共纳入难治性再生障碍性贫血患者40例,男17例,女23例,
年龄14~83岁,治疗前后血红蛋白浓度、中性粒细胞绝对值计数、血小板计数分别为83.5g/Lvs.119.0g/L、1.600×
109/Lvs.1.875×109/L、32.5×109/Lvs.46.0×109/L,差异具有统计学意义(均P<0.05)。治疗后1、3、6、12个月分别
有28例(70%)、28例(70%)、32例(80%)、35例(88%)患者获得血液学反应。结论 本研究构建的 T 细胞 miRNAmRNA 调控网络为研究 AA 提供了新的视角,临床研究初步验证含盐酸二甲双胍联合环孢素 A 方案治疗难治性 AA 安
全有效,副作用可接受,为临床治疗再生障碍性贫血提供了新的方法。