华中科技大学学报(医学版) ›› 2022, Vol. 51 ›› Issue (2): 172-179.doi: 10.3870/j.issn.1672-0741.2022.02.006

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细胞分裂周期相关蛋白(CDCAs)与乳腺癌发生、发展和转移的生物信息学分析

  

  1. 兰州大学1第一临床学院 3第一医院感染管理科,兰州 730000  甘肃省妇幼保健院2乳腺一科 4妇幼保健科研中心,兰州 730050
  • 收稿日期:2020-06-19 出版日期:2022-04-15 发布日期:2022-04-28
  • 通讯作者: 金凤玲,E-mail:jfljhk@163.com
  • 作者简介:刘婧婷,女,1993年生,硕士研究生,E-mail:liujt19@lzu.edu.cn
  • 基金资助:
    甘肃省自然科学基金资助项目(No.17JR5RA030) 

BioinformaticsAnalysisoftheCorrelationBetweentheExpressionofCellDivision Cycle-associated Protein (CDCAs) and Breast Cancer Development, Progression, Metastasis

  • Received:2020-06-19 Online:2022-04-15 Published:2022-04-28

摘要: 目的 利用生物信息学方法研究细胞分裂周期相关蛋白(CDCAs)介导乳腺癌的潜在靶向基因、信号传导通路 及分子机制。方法 从 GEO 和 TCGA 数据库下载正常乳腺组织和乳腺癌样本的基因芯片;使用 R 软件limma包分析 正常乳腺组织和乳腺癌样本之间的差异表达基因;使用 Kaplan-MeierPlotter评估乳腺癌患者的整体生存率、无复发生 存率和无远处转移生存率;对筛选出的差异表达基因进行 GO 和 KEGG信号通路富集分析。结果 通过对差异表达基 因的趋势分析,筛选出2015个显著上调的基因以及864个显著下调的基因,其中 CDCA1/2/3/5/7/8可能为介导乳腺癌 浸润性进展的相关基因。生存分析表明,乳腺癌 CDCA1/2/3/5/7/8高表达与不良预后相关(均 P<0.05)。GO 分析结 果主要富集于细胞有丝分裂周期、染色姐妹单体分离、染色体、着丝粒、纺锤体等;KEGG 信号通路富集分析则在卵母细 胞减数分裂、p53信号通路、DNA 复制显著富集。结论 整合生物信息学分析结果,表明 CDCAs在乳腺癌组织中表达 升高,并且 CDCAs表达水平显著影响乳腺癌患者预后,与其他 CDCAs相比,CDCA2/3/5/8可能是乳腺癌患者靶向治疗 的合适靶点。

关键词: 乳腺癌, 细胞分裂周期相关蛋白, 生物信息学 ,

中图分类号: