转录组测序分析ZNF185在食管鳞状细胞癌中的作用机制

doi:10.3870/j.issn.1672-0741.2022.03.001

华中科技大学学报（医学版） ›› 2022, Vol. 51 ›› Issue (3): 287-293.doi: 10.3870/j.issn.1672-0741.2022.03.001

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转录组测序分析ZNF185在食管鳞状细胞癌中的作用机制

华中科技大学同济医学院附属协和医院 1胸外科 2肿瘤科,武汉 430022

收稿日期:2021-12-16 出版日期:2022-06-15 发布日期:2022-07-07
通讯作者: E-mail:lijinsong67@hotmail.com (李劲松);1050313557@qq.com(郑志坤)
作者简介:共同第一作者：宋乃成,男,1996年生,硕士研究生,E-mail:m201975782@hust.edu.cn 王磊,男,1983年生,主治医师,E-mail:176230799@qq.com,现址:湖北省沙洋县人民医院普外二科,沙洋448208
基金资助:
湖北陈孝平科技发展基金会青年科学专项基金资助项目(No.CXPJJH11900018-05)

Received:2021-12-16 Online:2022-06-15 Published:2022-07-07

摘要/Abstract

摘要： 摘要:目的通过转录组测序及生物信息学技术分析 ZNF185在食管鳞状细胞癌(食管鳞癌)中的作用机制及其下游信号通路。方法利用shRNA 转染食管鳞癌细胞系 Eca-109敲低ZNF185的表达,采用转录组测序技术检测 mRNA 的表达变化。根据测序数据筛选差异基因,通过 GO 功能分析和 KEGG富集分析对差异基因相关的功能及信号通路进行分析。通过STRING工具分析差异蛋白的相互作用,构建出相关的蛋白互作网络,分析关键节点蛋白。结果 ZNF185干扰组与干扰对照组 Eca-109细胞的差异基因共有3859个,其中表达升高的基因有2112个,表达下降的基因有1747个。显著富集的 GO 项目包括 RNA 剪接、细胞-基质连接、局部粘附等。KEGG 富集分析表明 ZNF185可能与 HIF-1信号通路、p53信号通路有关,蛋白互作网络分析发现了 BMP2、OAS2等关键蛋白。结论通过转录组测序和生物信息分析筛选出ZNF185参与调控食管鳞癌可能的信号通路,为阐明食管鳞癌的发病机制提供了新的思路。

关键词: 食管鳞状细胞癌, ZNF185, 转录组测序, 信号通路 ,

中图分类号:

R735.1

宋乃成, 王磊, 张彬, 李寿康, 郑志坤, 李劲松. 转录组测序分析ZNF185在食管鳞状细胞癌中的作用机制[J]. 华中科技大学学报（医学版）, 2022, 51(3): 287-293.

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