基于分子对接和分子动态模拟探讨葛根素缓解大鼠心肌缺血再灌注损伤的作用机制

doi:10.3870/j.issn.1672-0741.23.10.006

华中科技大学学报（医学版） ›› 2024, Vol. 53 ›› Issue (1): 26-32.doi: 10.3870/j.issn.1672-0741.23.10.006

基于分子对接和分子动态模拟探讨葛根素缓解大鼠心肌缺血再灌注损伤的作用机制

1武汉科技大学医学院制药工艺研究所,职业危害识别与控制湖北省重点实验室,武汉 430065 2武汉科技大学附属武汉亚洲心脏病医院心内科,武汉 430022 3武汉科技大学附属武汉亚心总医院心内科,武汉 430058

收稿日期:2023-10-08 出版日期:2024-02-15 发布日期:2024-02-17
通讯作者: E-mail:drwangjiangyou@163.com
作者简介:张春艳,女,2001年生,硕士研究生,E-mail:1611960284@qq.com
基金资助:
国家自然科学基金资助项目(No.81801307);武汉市卫生健康科研基金资助项目(No.WX20Q31);湖北省自然科学基金资助项目 (No.2022CFB249)

The Effect of Puerarin in Alleviating Myocardial Ischemia-reperfusion Injury in Rats Based on Molecular Docking and Molecular Dynamics Simulation

Received:2023-10-08 Online:2024-02-15 Published:2024-02-17

摘要/Abstract

摘要： 摘要:目的基于分子对接和动态模拟,联合整体动物水平研究,揭示葛根素缓解心肌缺血再灌注损伤的具体作用机制。方法采用分子对接联合分子动态模拟技术预测葛根素与细胞沉默调节蛋白1(SIRT1)的结合潜力;结扎SD大鼠左冠状动脉前降支构建心肌缺血再灌注模型,观察给予葛根素对心肌损伤的保护作用,观察抑制SIRT1表达后葛根素对心肌损伤的保护作用变化。2,3,5-氯化三苯基四氮唑(TTC)染色评估梗死面积;TUNEL联合免疫荧光检测心肌细胞凋亡率和SIRT1表达;透射电镜观察心肌超微结构;Westernblot检测铁死亡相关蛋白表达。结果分子对接结果表明葛根素和SIRT1能够形成稳定的复合物发挥药效;在构建心肌缺血再灌注模型的大鼠体内给予葛根素处理,能明显改善心肌损伤,上调SIRT1、溶质载体家族成员11(SLC7A11)、谷胱甘肽过氧化物酶4(GPX4),并下调铁反应元件结合蛋白2(IREB2)表达;一旦抑制SIRT1蛋白表达后,则葛根素的心肌保护作用被抑制。结论分子对接和分子动态模拟技术能较好地预测葛根素与主要靶点SIRT1的作用潜力,葛根素通过激活SIRT1通路抑制铁死亡从而缓解心肌缺血再灌注损伤。

关键词: 分子对接, 分子动态, 葛根素, 心肌缺血再灌注, SIRT1 ,

中图分类号:

R542.22

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基于分子对接和分子动态模拟探讨葛根素缓解大鼠心肌缺血再灌注损伤的作用机制

The Effect of Puerarin in Alleviating Myocardial Ischemia-reperfusion Injury in Rats Based on Molecular Docking and Molecular Dynamics Simulation

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