《医学分子生物学杂志》现收录于美国《化学文摘》(Chemical Abstracts, CA)数据库(coden YFSZAO)、俄罗斯《文摘杂志》(Abstracts Journal, AJ)数据库及《哥白尼索引》(Index Copernicus)数据库等,是中国科技论文统计源期刊(中国科技论文核心期刊) 。
此外,本刊被RCCSE评价为“RCCSE中国核心学术期刊(A-)”,并被新华网-学术中国-知识产权服务平台收录。