《医学分子生物学杂志》是中国科技论文统计源期刊（中国科技论文核心期刊）,“RCCSE中国核心学术期刊”，与国内多个数据平台（中国知网、万方、维普、超星等）具有合作关系，是中国高校科技期刊与中国工程院院刊集群成员刊，并被收录于美国《化学文摘》（Chemical Abstracts, CA）数据库（coden YFSZAO）、俄罗斯《文摘杂志》（Abstracts Journal, AJ）数据库及《哥白尼索引》（Index Copernicus）数据库等。
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