华中科技大学学报（医学版） ›› 2025, Vol. 54 ›› Issue (6): 842-851.doi: 10.3870/j.issn.1672-0741.25.04.021
摘要:目的 基于中国食管癌高发区人群,通过比较食管鳞癌(esophagealsquamouscellcarcinoma,ESCC)患者和健康对照者口腔菌群分布特征和构成差异,鉴定 ESCC相关的特异性口腔菌群标志物,为筛选早期诊断和早期筛查 ESCC的菌群标志物奠定基础。方法 收集安阳市肿瘤医院经病理学确诊的48例原发性 ESCC患者和50例经性别、年龄匹配的健康对照的口腔拭子样本,进行 V3~V4区域16SrRNA 基因测序,采用 Wilcoxon秩和检验比较两组菌群 Alpha多样性及相对丰度差异,采用线性判别分析(lineardiscriminantanalysiseffectsize,LEfSe)筛选差异性物种,ROC曲线分析菌群预测 ESCC的价值。结果 ESCC患者菌群多样性低于健康对照组(P<0.05),且两组人群的菌群整体构成不同(P=0.001)。厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门、放线菌门和梭杆菌门是两组常见门类。相比于健康对照组,ESCC组厚壁菌门和梭杆菌门相对丰度升高,而变形菌门和放线菌门丰度减少(均 P<0.05);ESCC组链球菌属、梭杆菌属、拟普雷沃氏菌属和纤毛菌属等属的丰度显著提升,而奈瑟菌属、二氧化碳噬纤维菌属等属的丰度下降(均 P<0.05)。特别重要的是,牙龈卟啉单胞菌、牙髓卟啉单胞菌、坦纳拟普雷沃菌、南锡普雷沃菌等菌种在 ESCC组富集;联合南锡普雷沃菌、坦纳拟普雷沃菌和牙龈卟啉单胞菌区分 ESCC与健康个体(AUC=0.728,特异度0.760,灵敏度0.646)的效果优于任一单个菌种。结论 牙龈卟啉单胞菌、坦纳拟普雷沃菌、南锡普雷沃菌和牙髓卟啉单胞菌是初步筛查 ESCC 患者的菌群标志物,且联合前三个菌种有区分 ESCC与健康个体的良好效能。
摘要： 摘要:目的 基于中国食管癌高发区人群,通过比较食管鳞癌(esophagealsquamouscellcarcinoma,ESCC)患者和健康对照者口腔菌群分布特征和构成差异,鉴定 ESCC相关的特异性口腔菌群标志物,为筛选早期诊断和早期筛查 ESCC的菌群标志物奠定基础。方法 收集安阳市肿瘤医院经病理学确诊的48例原发性 ESCC患者和50例经性别、年龄匹配的健康对照的口腔拭子样本,进行 V3~V4区域16SrRNA 基因测序,采用 Wilcoxon秩和检验比较两组菌群 Alpha多样性及相对丰度差异,采用线性判别分析(lineardiscriminantanalysiseffectsize,LEfSe)筛选差异性物种,ROC曲线分析菌群预测 ESCC的价值。结果 ESCC患者菌群多样性低于健康对照组(P<0.05),且两组人群的菌群整体构成不同(P=0.001)。厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门、放线菌门和梭杆菌门是两组常见门类。相比于健康对照组,ESCC组厚壁菌门和梭杆菌门相对丰度升高,而变形菌门和放线菌门丰度减少(均 P<0.05);ESCC组链球菌属、梭杆菌属、拟普雷沃氏菌属和纤毛菌属等属的丰度显著提升,而奈瑟菌属、二氧化碳噬纤维菌属等属的丰度下降(均 P<0.05)。特别重要的是,牙龈卟啉单胞菌、牙髓卟啉单胞菌、坦纳拟普雷沃菌、南锡普雷沃菌等菌种在 ESCC组富集;联合南锡普雷沃菌、坦纳拟普雷沃菌和牙龈卟啉单胞菌区分 ESCC与健康个体(AUC=0.728,特异度0.760,灵敏度0.646)的效果优于任一单个菌种。结论 牙龈卟啉单胞菌、坦纳拟普雷沃菌、南锡普雷沃菌和牙髓卟啉单胞菌是初步筛查 ESCC 患者的菌群标志物,且联合前三个菌种有区分 ESCC与健康个体的良好效能。
